MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl53

Total Repeats: 1690

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011260	TTC	2	6	7	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011260	AGG	2	6	96	101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011260	T	8	8	108	115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011260	CCA	2	6	122	127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_011260	TCC	2	6	226	231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_011260	AAG	2	6	246	251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011260	ATTC	2	8	268	275	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_011260	AAT	2	6	284	289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011260	CT	3	6	315	320	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_011260	TCCT	2	8	326	333	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_011260	TCC	3	9	338	346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_011260	CAC	2	6	359	364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_011260	ATC	4	12	366	377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011260	ATT	2	6	381	386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011260	TAT	2	6	412	417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011260	CT	4	8	436	443	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_011260	CT	4	8	446	453	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_011260	TC	3	6	457	462	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_011260	T	8	8	468	475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011260	TC	3	6	478	483	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_011260	CCT	2	6	497	502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_011260	TATTTT	2	12	503	514	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011260	T	6	6	511	516	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011260	A	6	6	536	541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011260	AAAT	2	8	543	550	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011260	TAA	2	6	558	563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011260	A	7	7	583	589	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011260	CT	3	6	595	600	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_011260	ATA	2	6	627	632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011260	AT	3	6	649	654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011260	ATTA	2	8	667	674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011260	GATT	2	8	675	682	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011260	ATAAA	2	10	740	749	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011260	ATT	2	6	752	757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011260	ATT	2	6	763	768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011260	A	6	6	779	784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011260	A	6	6	798	803	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011260	A	7	7	809	815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011260	TA	3	6	830	835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011260	GAA	2	6	836	841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011260	ATTT	3	12	844	855	25 %	75 %	0 %	0 %	203288437
42	NC_011260	TAA	2	6	868	873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288437
43	NC_011260	TAA	2	6	891	896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288437
44	NC_011260	TAATTT	2	12	919	930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288437
45	NC_011260	TTA	2	6	1028	1033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288437
46	NC_011260	TAG	2	6	1047	1052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288437
47	NC_011260	CTT	2	6	1118	1123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288437
48	NC_011260	TTA	2	6	1136	1141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288437
49	NC_011260	TAT	2	6	1158	1163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288437
50	NC_011260	CTA	2	6	1169	1174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288437
51	NC_011260	TTC	2	6	1180	1185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288437
52	NC_011260	T	6	6	1200	1205	0 %	100 %	0 %	0 %	203288437
53	NC_011260	ATC	2	6	1297	1302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288437
54	NC_011260	TAC	2	6	1360	1365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288437
55	NC_011260	CAT	2	6	1372	1377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288437
56	NC_011260	TA	3	6	1398	1403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011260	ATT	2	6	1404	1409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011260	TTTA	2	8	1540	1547	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011260	AT	3	6	1564	1569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011260	ATAA	2	8	1580	1587	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011260	TA	4	8	1638	1645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011260	ATA	2	6	1658	1663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011260	ATC	2	6	1669	1674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011260	TAAA	2	8	1678	1685	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011260	ACA	2	6	1689	1694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011260	CTT	2	6	1750	1755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_011260	ATC	2	6	1795	1800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_011260	TAA	3	9	1863	1871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011260	TTG	2	6	1980	1985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011260	GCTT	2	8	1990	1997	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_011260	CAC	2	6	2038	2043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_011260	ATA	2	6	2175	2180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011260	A	6	6	2194	2199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011260	TCTTT	2	10	2200	2209	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_011260	T	6	6	2267	2272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011260	A	7	7	2282	2288	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011260	AATC	2	8	2308	2315	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_011260	ATA	2	6	2414	2419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011260	AT	3	6	2507	2512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011260	TTA	2	6	2529	2534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011260	TAT	2	6	2549	2554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011260	CA	3	6	2586	2591	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_011260	TAA	2	6	2602	2607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011260	ATTA	2	8	2624	2631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011260	TCTTT	2	10	2679	2688	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_011260	ATA	2	6	2694	2699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011260	AT	3	6	2704	2709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011260	TTA	2	6	2766	2771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011260	AAT	2	6	2811	2816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011260	A	6	6	2847	2852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011260	ATT	2	6	2875	2880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011260	GGA	2	6	2925	2930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011260	ATC	2	6	2943	2948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_011260	A	6	6	2949	2954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011260	TCAAAA	2	12	2960	2971	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_011260	TTA	2	6	2981	2986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011260	AAC	2	6	3057	3062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_011260	ATT	2	6	3109	3114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011260	A	6	6	3116	3121	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011260	AAC	2	6	3187	3192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_011260	TTA	2	6	3202	3207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011260	ATG	2	6	3233	3238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011260	AT	3	6	3247	3252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011260	A	8	8	3272	3279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011260	ACAAA	2	10	3285	3294	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_011260	A	6	6	3292	3297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011260	GTCA	2	8	3334	3341	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_011260	TAT	2	6	3342	3347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011260	ATA	2	6	3350	3355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011260	A	6	6	3355	3360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011260	A	6	6	3378	3383	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011260	AGA	2	6	3447	3452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011260	AAATAA	2	12	3453	3464	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011260	A	7	7	3463	3469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011260	AG	3	6	3477	3482	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011260	TTA	2	6	3542	3547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011260	A	7	7	3585	3591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011260	GAT	2	6	3616	3621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011260	T	6	6	3635	3640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011260	ATA	2	6	3662	3667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011260	ATT	2	6	3668	3673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011260	AAT	2	6	3697	3702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011260	GTT	2	6	3727	3732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011260	CAAA	2	8	3739	3746	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_011260	ATAA	2	8	3762	3769	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011260	A	6	6	3794	3799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011260	GTA	2	6	3831	3836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011260	AT	3	6	3837	3842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011260	TAG	2	6	3906	3911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011260	TTA	2	6	3938	3943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011260	CTA	2	6	3951	3956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_011260	TAG	2	6	3992	3997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011260	TA	3	6	4004	4009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011260	T	6	6	4021	4026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011260	TGTGA	2	10	4030	4039	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011260	ACCT	2	8	4064	4071	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_011260	AAAT	2	8	4092	4099	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011260	AT	4	8	4112	4119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011260	T	6	6	4132	4137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011260	ATT	2	6	4140	4145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011260	TA	3	6	4157	4162	50 %	50 %	0 %	0 %	203288438
142	NC_011260	TTTA	2	8	4164	4171	25 %	75 %	0 %	0 %	203288438
143	NC_011260	TTTA	2	8	4191	4198	25 %	75 %	0 %	0 %	203288438
144	NC_011260	TATTT	2	10	4233	4242	20 %	80 %	0 %	0 %	203288438
145	NC_011260	GTT	2	6	4247	4252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288438
146	NC_011260	AAT	2	6	4273	4278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288438
147	NC_011260	GAA	2	6	4303	4308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288438
148	NC_011260	A	7	7	4314	4320	100 %	0 %	0 %	0 %	203288438
149	NC_011260	A	6	6	4378	4383	100 %	0 %	0 %	0 %	203288438
150	NC_011260	AT	3	6	4415	4420	50 %	50 %	0 %	0 %	203288438
151	NC_011260	ATA	2	6	4442	4447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288438
152	NC_011260	A	6	6	4462	4467	100 %	0 %	0 %	0 %	203288438
153	NC_011260	TGG	2	6	4470	4475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	203288438
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292	NC_011260	GAC	2	6	9057	9062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
293	NC_011260	TA	3	6	9065	9070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_011260	AAT	2	6	9141	9146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_011260	GAAG	2	8	9206	9213	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
296	NC_011260	TAAG	2	8	9271	9278	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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299	NC_011260	TAG	2	6	9358	9363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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309	NC_011260	CAG	2	6	9634	9639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
310	NC_011260	GCA	2	6	9645	9650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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323	NC_011260	TAC	2	6	10089	10094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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326	NC_011260	TTC	2	6	10130	10135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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418	NC_011260	AGA	2	6	13320	13325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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423	NC_011260	AGA	2	6	13489	13494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
424	NC_011260	A	6	6	13511	13516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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432	NC_011260	AAAG	2	8	13818	13825	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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